根据联盟的架构，联盟将设立联盟成员大会、常任理事会和秘书处。联盟成员大会为联盟最高决策机构，常任理事会为联盟常设管理机构；秘书处为常任理事会的执行机构。

一、常任理事会

1.    理事长单位：

华南农业大学

理事长：

华南农业大学刘雅红校长

 2. 副理事长单位：

（1）中国高校名单（共5个）：

（2）拉美高校名单（共14个）：

墨西哥查宾戈自治大学

秘鲁国立农业大学

巴西圣玛利亚联邦大学

哥伦比亚国立大学

委内瑞拉国立实验大学

阿根廷国立沿海大学

哥伦比亚佩雷拉科技大学

玻利维亚加布里埃尔·雷内·莫雷诺自治大学

哥斯达黎加国立大学

智利南方大学

乌拉圭共和国大学

厄瓜多尔马纳比农业大学

巴拿马大学科克莱校区

多米尼加农牧林研究所

副理事长：上述机构负责人或分管外事的校（院）领导

二、秘书处

1. 中方秘书处：

    华南农业大学

    中方秘书长：

    华南农业大学国际事务仇荣亮副校长

 2. 拉美秘书处：